Cystická fibróza (CF) je nejčastějším autozomálně recesívně dědičným onemocněním v české populaci.

Obecně o cystické fibróze

Incidence CF se v České republice odhaduje na 1:2700-3800 novorozenců a každý 26.-33. jedinec je zdravým nosičem mutace v genu CFTR. Pro klasický obraz CF je charakteristické chronické onemocnění sinopulmonálního a gastrointestinálního systému a bilaterální ageneze vas deferens u mužů. Za patogenezi CF je zodpovědný bílkovinný produkt genu pro CF nazývaný transmembránový regulátor vodivosti (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator - CFTR). V současné době je známo více než 1500 mutací tohoto genu, z toho přes 1200 patogenních mutací (viz aktuální stav v Cystic Fibrosis Genetic Analysis Consortium Dabatase - CFGAC; http://www.genet.sickkids.on.ca/cftr/app). 

Naprostá většina dosud známých mutací je však privátních a pouze 30 mutací (1717-1G>A, 1898+1G>A, 2184delA, 2789+5G>A, 3120+1G>A, 3659delC, 3849+10kbC>T, 621+1G>T, 711+1G>T, A455E, F508del, I507del, G542X, G551D, G85E, N1303K, R1162X, 1161delC, S549N, R117H, R334W, R347P, R553X, R560T,W1282X, 1078delT, 394delTT, CFTRdele2,3(21kb), 3272-26A>G a D1152H) se vyskytuje s četností více než 0,1 %. Mnohé mutace jsou populačně specifické a/nebo se nacházejí ve vyšší prevalenci v izolovaných populacích či náboženských skupinách.

Charakteristika a zaměření pracoviště

Centrum pro diagnostiku a léčbu cystické fibrózy (dále Centrum cystické fibrózy - Centrum CF) bylo ustanoveno v r.1997 ve FN Motol na základě výnosu Vlády České republiky ze dne 8. září 1993, # 493 Sekce 3, § 3i. Centrum CF bylo vytvořeno funkčním spojením specializovaných částí 2. dětské kliniky a Ústavu biologie a lékařské genetiky FN Motol a UK 2. LF, které svou dlouholetou spoluprací, odborným, personálním a metodickým vybavením poskytují komplexní služby rodinám dětí postižených CF na základě nejnovějších znalostí lékařské genetiky a klinické medicíny. 

Naše specializovaná molekulárně genetická laboratoř provádí vyšetření mutací genu CFTR u pacientů s CF, jejich rodičů a všech příbuzných, zajišťuje odborné genetické poradenství pro postižené a jejich rodiny. Ve spolupráci s Gynekologicko-porodnickou klinikou poskytujeme rodičům veškerou péči před otěhotněním a během těhotenství k zajištění narození dítěte nepostiženého CF. Molekulárně genetická laboratoř usiluje stále o vylepšení svých služeb postiženým rodinám. Ve spolupráci s Oddělením reprodukční genetiky a medicíny ÚBLG umožňuje primární a sekundární prevenci CF u všech partnerů s poruchami reprodukce a připravuje klinické využití preimplantační genetické diagnostiky, založené na využití nejnovějších metod asistované reprodukce. 

Centru CF byla udělena certifikace kvality pro molekulárně genetickou diagnostiku CF v letech 1997-2005 (CF Thematic Network a Eurogentest EU). Současně Centrum CF působí jako školící pracoviště pro ostatní laboratoře ve střední a východní Evropě pro metodiku detekce mutací v genu CFTR - v rámci projektu EU, CF Thematic Network a Eurogentest. Rovněž působí jako školící pracoviště v molekulární genetice pro mezinárodni studentskou asociaci CzeMSIC/IFMSA. Nabízíme školení v molekulární genetice v rámci postgraduálního studia IPVZ Praha. 

Ve většině diagnostických situací lze použít přímou diagnostiku mutací genu CFTR. Dle doporučení CF Thematic Network by měla být minimální populační záchytnost mutací alespoň 80 procent. K zvýšení efektivity diagnostických algoritmů při přímé diagnostice nejčastějších mutací genu CFTR je doporučena tzv. kaskádová strategie jejich analýzy, která v sestupné řadě umožňuje postupný záchyt od nejčastějších až po relativně vzácné mutace.

Nabízené služby

Na našem pracovišti provádíme rutinní molekulárně genetickou diagnostiku těchto mutací a polymorfismů genu CFTR:

Metody používané při detekci mutací, variant a polymorfismů genu CFTR:

• Molekulárně genetické vyšetření  50 mutací a Tn polymorfismů genu CFTR pomocí kitu ELUCIGENE™ CF-EU2   (SOPm: G-3009)

• Molekulárně genetické vyšetření mutace F508del genu CFTR pomocí PCR reakce s fluorescenčně značeným párem primerů (SOPm: G - 3001)

• Molekulárně genetické vyšetření mutací/polymorfismů CFTR genu pomocí PCR reakce a analýzy v agarozovém gelu (SOPm: G-3002)

• Molekulárně genetické vyšetření mutací/polymorfismů CFTR genu pomocí PCR reakce, digesce restrikční endonukleasou a analýzy v agarozovém gelu (SOPm: G-3003)

• Molekulárně genetické vyšetření mutací genu CFTR metodou MLPA (SOPm: G-3201)

• Molekulárně genetické vyšetření mikrodelečních syndromů metodou MLPA – vyšetření rozsáhlejších delecí / duplikací oblastí chromozomů spojených s vybranými mikrodelečními syndromy (SOPm: G-3202)

• Molekulárně genetická detekce mutací/SNP genu CFTR pomocí sekvenování (SOPm: G-3004)

• Molekulárně genetické vyšetření mutací genu CFTR pomocí Idaho Technology (High Resolution Melting Curve Analysis, HRMCA) (SOPm:  G-3054)

• Molekulárně genetické vyšetření genu CFTR je zahrnuto do hodnocení externí kontroly kvality (EQA), Cystic Fibrosis European Network, Leuven, Belgium.

Další nabízené služby:

• Molekulárně genetické vyšetření trombofilních mutací (FV-Leiden, FV-Cambridge, FII, PAI, MTHFR):
• Molekulárně genetické vyšetření trombofilní mutace PAI-1 4G/5G pomocí PCR reakce, digesce restrikční endonukleasou v agarosovém gelu (SOPm G-3052).
• Molekulárně genetické vyšetření trombofilní mutace A1298C genu pro MTHFR pomocí PCR reakce, digesce restrikční endonukleasou v agarosovém gelu (SOPm G-3053).
• Molekulárně genetické vyšetření trombofilních mutací je zahrnuto do hodnocení externí kontroly kvality (EQA, 1x ročně), zajišťované ÚHKT U Nemocnice 1, 128 20, Praha 2.

• Molekulárně genetické vyšetření aneuploidií a stanovení pohlaví metodou multiplexní QFPCR (SOPm G-3152). Tato metoda je zahrnuta do mezilaboratorní kontroly kvality práce, EQA (referenční laboratoř Fakultní nemocnice Brno, oddělení lékařské genetiky, Černopolní 9, 625 00 Brno).

• Molekulárně genetické vyšetření mutací genů odpovědných za hereditární a idiopatickou pankreatitidu: mutace N29I a R122H v genu PRSS1 a mutace N34S v genu SPINK1 pomocí PCR reakce, digesce restrikční endonukleasou a analýzy v agarozovém gelu (SOPm G-3101).

• Molekulárně genetické vyšetření  mikrodelečních syndromů  metodou MLPA - vyšetření: rozsáhlejších delecí/ duplikací  oblastí chromozomů spojených s vybraný mimikrodelečními syndromy (SOP_G-3202)

Konzultace a telefonické hlášení výsledků:

(+420) 224 433 528 (-529) - Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript (+420) 224 433 535 (-528) -  Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript (+420) 224 433 528 (-529) - Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript Vyšetření mutací genu CFTR, vyšetření mutací genu CFTR metodou MLPA, vyšetření trombofilních mutací, vyšetření chromozómových aneuploidií a pohlaví, molekulárně genetické vyšetření mikrodelečních syndromů metodou MLPA, vyšetření pro hereditární a idiopatickou pankreatitidu   (+420) 224 433 528 (-535) - MUDr. Turnovec Marek Vyšetření trombofilních mutací

Vedoucí centra cystické fibrózy:

RNDr. Alexandra Štambergová, CSc. 
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript

tel.: (+420) 224 433 539 
fax: (+420) 224 433 520